Lancer et gérer une pharmacie en ligne est une aventure excitante. Mais attention : ta réussite passe aussi par une comptabilité béton.

TVA multi-taux, marges réglementées, stocks sous contrôle, statut juridique à choisir… ça peut vite devenir un casse-tête.

Heureusement, avec un expert-comptable digital comme Comptacool, tu gagnes du temps, de la sérénité et surtout… plus de net.

1) Pourquoi la compta est critique pour une pharmacie en ligne ?

Une officine digitale, ce n’est pas juste un site e-commerce classique. Tu es soumis à des règles spécifiques :

• TVA santé : 2,1 % (médicaments remboursés), 10 % (certains produits santé), 20 % (parapharmacie, cosmétiques). Une erreur = redressement.
• Marge réglementée : contrairement à d’autres commerces, tes marges sont plafonnées par la loi.
• Stocks sensibles : obligation de tracer les lots, dates de péremption, numéros d’AMM.
• Contrôles : fiscaux (TVA, IS/IR), sociaux (URSSAF), et pharmaceutiques (Ordre, ARS).

2) Pharmacie en ligne vs pharmacie physique : différences comptables

Aspect	Pharmacie physique	Pharmacie en ligne
TVA	Principalement 2,1 % et 10 %	Mix 2,1 % / 10 % / 20 % (parapharmacie)
Stocks	Gestion locale + inventaire	Gestion multi-entrepôts + logistique e-commerce
Marge	Encadrée	Encadrée, mais pression concurrentielle en plus
Outils	Logiciel officinal	ERP e-commerce + compatibilité santé

👉 En clair : tu dois être encore plus rigoureux que dans une officine physique, car tes flux sont massifs et 100 % dématérialisés.

3) Exemple chiffré : l’impact TVA/marge

Cas simplifié :

• Ventes mensuelles : 100 000 €
• Répartition : 50 % médicaments remboursés (2,1 %), 30 % produits santé (10 %), 20 % parapharmacie (20 %)

TVA collectée :

• 50 000 € × 2,1 % = 1 050 €
• 30 000 € × 10 % = 3 000 €
• 20 000 € × 20 % = 4 000 €

Total TVA = 8 050 € à déclarer/reverser chaque mois. Imagine si tu te trompes de taux… le redressement peut coûter des dizaines de milliers d’euros.

4) Quel statut juridique pour une pharmacie en ligne ?

Ton choix de statut impacte directement ta fiscalité et ta protection sociale.

Statut	Points forts	À surveiller
SELAS	Souplesse SAS, dividendes optimisés, image pro	IS obligatoire, formalisme
SELARL	Adaptée aux professions libérales, cadre connu	Moins souple que SAS, charges gérant majoritaire
SASU	Idéal si tu démarres seul, capital souple	Moins adapté si plusieurs associés pharmaciens

👉 Comptacool t’aide à choisir et simule pour toi l’impact IS vs IR, dividendes vs salaire, et optimise ta rémunération.

5) Obligations comptables et fiscales

• Comptabilité complète : journal des ventes, achats, banque, stocks.
• Déclarations TVA : CA3/CA12 selon régime.
• Liasse fiscale : 2065 (sociétés IS) ou 2035 (libéraux BNC).
• Contrôles : fiscaux + ARS/Ordre.

Ressource officielle : Ordre national des pharmaciens

6) Pourquoi choisir Comptacool pour ta pharmacie en ligne ?

On ne se contente pas de “tenir tes livres”. On te fait gagner du net :

• Expertise santé : déjà spécialistes professions médicales (voir nos pages Compta Médecin, Compta Kiné, Compta infirmère). Mais surtout on tient déjà la compta de plusieurs pharmacies.
• Digital natif : appli sécurisée, upload factures, tableau de bord temps réel.
• Optimisation : simulation IR/IS, arbitrage rémunération/dividendes, amortissements.
• Prévention : alertes TVA, seuils, URSSAF, marge réglementée.

Passe à la vitesse supérieure

Ta pharmacie en ligne ne doit pas être freinée par la paperasse.

Avec Comptacool, tu anticipes la TVA, tu pilotes tes marges et tu dors tranquille.
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FAQ – Comptabilité pharmacie en ligne

Quel taux de TVA appliquer en pharmacie en ligne ?

2,1 % sur les médicaments remboursés, 10 % sur certains produits de santé, 20 % sur la parapharmacie/cosmétique.

Quel statut choisir pour une pharmacie en ligne ?

SELAS ou SELARL si plusieurs pharmaciens, SASU si tu démarres seul. Comptacool simule et optimise ton choix.

Quels risques en cas d’erreur comptable ?

Redressement fiscal (TVA, IS/IR), sanctions disciplinaires de l’Ordre, perte de crédibilité auprès des patients.

Un expert-comptable en ligne suffit-il ?

Oui, surtout s’il est spécialisé santé. Nous chez Comptacool on tient déjà la comptabilité de plusieurs pharmacies !

Expert comptable – Pharmacie