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Cet article est un guide complet sur la comptabilité pour les médecins en exercice libéral. Il aborde les spécificités de ta profession : gestion des revenus (Sécurité Sociale, mutuelles), charges professionnelles déductibles (RCP, CARMF, Ordre), et le choix crucial de ton statut juridique (BNC avec déclaration 2035 vs. Société d’Exercice Libéral – SEL).
L’article explique le rôle d’une Association de Gestion Agréée (AGA) et te propose Comptacool comme l’expert-comptable spécialiste des professionnels de santé, offrant gain de temps et sérénité.
Ta journée de médecin VS ta compta …
Ta journée type ? Elle commence bien avant 8h et se termine bien après 20h. Entre les consultations qui s’enchaînent, les diagnostics qui mobilisent toute ta concentration, l’urgence à gérer et la charge émotionnelle de tes patients… tu donnes tout. Ta vocation, c’est de soigner.
Et puis, le soir, une fois la porte du cabinet fermée, le deuxième marathon commence. Les relevés de la Sécu, les paiements des mutuelles, les factures de matériel, les déclarations à l’URSSAF, les cotisations à la CARMF… La douche froide administrative.
Cette charge mentale, en plus de tout le reste, est épuisante. Et elle te détourne de ta mission essentielle.
Stop. Ton expertise, c’est la santé de tes patients. La nôtre, c’est la santé financière de ton cabinet. En tant qu’expert-comptable spécialiste des professions libérales de santé, je sais que ton temps est ton bien le plus précieux. Ce guide est pensé pour toi : simple, direct, et avec un seul objectif, te libérer l’esprit.
Le Diagnostic : Pourquoi la Compta d’un Médecin est un Cas à Part
Ta comptabilité ne ressemble à aucune autre. Elle est complexe par nature, et nier cette complexité est la première erreur.
Des Flux de Revenus Multiples
Tu ne reçois pas simplement un virement de la part d’un client.
Tu jongles en permanence entre les remboursements de la Sécurité Sociale, les tiers payants des mutuelles, les paiements directs des patients, les dépassements d’honoraires et parfois même les rétrocessions d’honoraires si tu travailles en groupe. Suivre tout cela sans erreur est un travail à plein temps.
Des Charges Professionnelles Très Spécifiques
Tes dépenses sont uniques et doivent être gérées avec une rigueur absolue pour optimiser ta fiscalité. On parle bien sûr de :
- Ton assurance en Responsabilité Civile Professionnelle (RCP), souvent très coûteuse.
- Tes cotisations à l’Ordre des Médecins.
- Tes colossales cotisations à la CARMF (ta caisse de retraite).
- Tes frais de formation continue (DPC).
- L’achat de matériel médical, du plus petit au plus coûteux.
- Les frais de remplacement lorsque tu prends (enfin) des vacances.
Le Choix Crucial de la Structure : BNC ou Société d’Exercice Libéral (SEL) ?
La plupart des médecins démarrent en BNC (Bénéfices Non Commerciaux), avec une comptabilité de trésorerie (recettes-dépenses) et une déclaration 2035. Mais avec l’augmentation de tes revenus, le passage en SEL (SELARL ou SELAS) peut devenir beaucoup plus intéressant pour mieux piloter ta rémunération et optimiser tes impôts. C’est un choix stratégique qui ne doit pas être fait à la légère.

Ton Ordonnance Comptable : Les 3 Piliers d’une Gestion Sereine
Pour une « santé financière » de fer, voici les 3 gestes essentiels que je mets en place for mes clients médecins.
Pilier 1 : L’Adhésion à une AGA (Association de Gestion Agréée)
Si tu es en BNC, c’est le geste qui sauve. Adhérer à une AGA est quasi-obligatoire dans les faits. Pourquoi ? Car sans cela, l’administration fiscale majore automatiquement de 10% (pour 2025) ton bénéfice imposable. C’est une « punition » pour non-contrôle. L’AGA va viser tes comptes, et cette simple validation t’évite une imposition supplémentaire. C’est le premier conseil que je te donne.
Pilier 2 : La Tenue de Compte « Zéro Oubli »
La clé de ton optimisation est de n’oublier aucune dépense professionnelle. Du stéthoscope à ton abonnement au Lancet, en passant par tes frais de déplacement pour une visite à domicile et une partie des charges de ton logement si ton cabinet y est… chaque euro compte. Utiliser un outil moderne connecté à ta banque, qui te permet de prendre en photo tes reçus, n’est plus une option.
Pilier 3 : L’Anticipation de tes Cotisations (URSSAF & CARMF)
Le piège pour de nombreux médecins, ce sont les rappels de régularisation colossaux de l’URSSAF et de la CARMF, basés sur tes revenus d’il y a deux ans. Cela peut créer des trous de trésorerie dramatiques.
Mon rôle est de mettre en place un prévisionnel précis. Dès qu’un euro est encaissé, nous savons quelle part doit être provisionnée. Fini les mauvaises surprises, tu pilotes ton activité avec une visibilité totale.

Choisir ton « Spécialiste » : Ce que tu dois attendre de ton Expert-Comptable
Tu ne confierais pas un diagnostic complexe à un généraliste. C’est la même chose pour ta comptabilité.
Il Connaît le Secteur de la Santé
Il doit savoir ce qu’est la CARMF, une AGA, une SELARL, sans que tu aies à lui expliquer. Il doit comprendre ton métier et savoir remplir ta 2035…
Il Te Fait Gagner du Temps (Vraiment)
Son organisation doit être pensée pour toi. Des outils en ligne simples, une application mobile pour envoyer tes notes de frais, des déclarations automatisées… Sa mission est de te faire passer le moins de temps possible sur ton administration.
Il est Ton Stratège, pas un simple Saisisseur
Un bon expert-comptable ne se contente pas de remplir des cases. Il est proactif. Il t’appelle en fin d’année pour te dire : « Attention, il serait judicieux de faire cet investissement maintenant pour optimiser ton impôt ». Il t’aide à préparer ta retraite, à protéger ta famille.

Comptacool : Notre Engagement pour les Professionnels de Santé
C’est précisément cette vision que nous défendons chez Comptacool.
Nous Parlons le Langage de la Santé
Nous accompagnons de nombreux médecins et professionnels de santé. Tes enjeux sont notre quotidien.
Une Technologie qui Te Libère l’Esprit
Notre plateforme est conçue pour être utilisée en quelques minutes par semaine, pas plus. Prends une photo de ta facture, c’est catégorisé. Ton compte bancaire est synchronisé, c’est suivi.
Un Accompagnement Proactif pour Protéger Ton Avenir
Nous ne sommes pas une simple application. Tu as un interlocuteur dédié, un expert qui connaît ton dossier et qui t’aide à prendre les meilleures décisions stratégiques pour ton patrimoine.
Comptacool : Un expert comptable pour t’accompagner
Ton métier est de prendre soin des autres, avec un dévouement qui force l’admiration. Mais pour bien soigner, il faut aussi prendre soin de soi et de la santé de son cabinet.
Déléguer ta comptabilité à un spécialiste n’est pas un luxe, c’est un acte de bonne gestion et de préservation de ton propre bien-être. C’est la décision qui te permet de te recentrer sur ce qui compte vraiment.
Concentre-toi sur tes patients. Nous nous occupons du reste.
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La comptabilité simplifiée spécialement pour les indépendants
Découvrez les retours enthousiastes de nos clients, témoignant de leur confiance et de la simplicité apportée par nos services.
Merci pour votre accompagnement !

Caroline
Freelance Data Analyst
Merci pour m’avoir évité les soucis avec l’administration fiscale.

Ali
Chauffeur VTC
Mon expert comptable m’a planté et vous m’avez sorti de la mouise !

Sophie
Entrepreneure
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